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厦门论文发表-细菌前体和不饱和长链脂肪酸是北大西洋深海演示海绵的生物标志物
发表时间:2021-07-12     阅读次数:     字体:【

厦门论文发表-细菌前体和不饱和长链脂肪酸是北大西洋深海演示海绵的生物标志物

· 安娜·德·克鲁伊弗

· 克拉斯·尼罗普

· 特蕾莎·摩根蒂

· 马蒂恩·巴特

· 比特·斯拉比

· 乌尔里克·汉兹

· 贾斯珀·德·戈伊

· 富鲁·米尼斯

· 杰克·米德堡

· 发布时间: 2021年1月27

· https://doi.org/10.1371/journal.pone.0241095

抽象

海绵产生独特的脂肪酸(FAs),(可能)可用作化学轴学和生态生物标志物,用于研究内源性宿主相互作用和海绵的功能生态学。在这里,我们介绍了五个共同的栖息地建设深海海绵(类德莫蓬吉亚,秩序特拉特蒂内利达),这是被列为高微生物丰度(HMA)物种的FA配置文件。吉奥迪亚·亨切利帕尔瓦 G.大西洋,G.巴雷蒂斯泰莱塔·拉菲迪奥波拉是从北大西洋的北大西洋和北极海绵地采集的。细菌法斯在所有五个物种中占主导地位,特别是中链分支FAs(MBFAs、8-和9-Me-C)的异位混合物16:0和10-和11-我-C18:0)被发现在高丰度(加起来≥20%的总FAs)除了更常见的细菌标记。此外,海绵还生产出长链线性、中线性和a(i)分支不饱和性FAs(LCFAs),链长为24°u201228 C原子,主要具有典型的Δ5,9不饱和,虽然Δ9,19和(尚未描述)Δ11,21也发现了不令人满意的问题。G.帕瓦S.拉菲迪奥波拉各自产生了不同的LCFA,而G.大西洋,G.巴雷蒂G.亨切利生产了类似的LCFA,但比例不同。不同的细菌前体在碳同位素组成上各不相同(δ13C),与其他细菌(线性和(i)分支的FAs相比,MBFA更加丰富。我们建议生物合成途径,以不同LCFA从他们的细菌前体,这是符合在LCFAs中发现的小同位素差异。事实上,深海海绵的FA轮廓可以作为化学轴学标记,并支持海绵从其内生菌中获取积木的概念。

引文: de Kluijver A, 尼罗普 KGJ, 摩根蒂 TM, 巴特 MC, 斯拉比 BM, 汉兹 U 等人 (2021) 细菌前体和不饱和长链脂肪酸是北大西洋深海演示海绵的生物标志物。PLoS ONE 16(1):e0241095。https://doi.org/10.1371/journal.pone.0241095

编辑:克拉拉·罗德里格斯,阿韦罗大学,葡萄牙

收到:2020年10月6日:接受:2020年12月18日:已发布:2021年1月27日

版权所有2021年?德克鲁伊弗等人。这是一个开放访问文章,根据《知识共享归属许可证》的条款分发,允许在任何媒体上不受限制地使用、分发和复制,前提是原始作者和来源得到记分。

数据可用性:所有相关数据均在手稿及其支持信息文件中。

资金:这项研究是在欧盟海绵项目范围内进行的,该项目根据第679849号赠款协议从欧盟的Horizno 2020研究和创新方案获得资金。本文件仅反映作者的意见,中小企业执行机构(EASME)不负责对所包含的信息的任何使用。进一步的支持包括ERC开始向J.de Goeij博士提供第715513号赠款协议.M,荷兰地球系统科学中心向J.J.米德堡教授提供赠款。F. Mienis博士得到荷兰科学研究组织创新研究奖励计划(NWO-VIDI赠款第0.16.161.360号)的支持。额外资金来自不来梅大学的DFG卓越集群"地球系统的海洋"(第49926684号赠款)和ERC Adv Grant ABYSS,这两个基金都来自安杰·博蒂乌斯教授(第2厦门论文发表-94757号赠款)。资助者在研究设计、数据收集和分析、出版决定或编写手稿方面没有作用。

竞争利益:作者宣称不存在相互竞争的利益。

介绍

海绵是几乎所有水生生态系统(包括深海[1])的丰富居民。它们是具有独特特征的嵌套过滤器喂料器,例如它们巨大的过滤能力及其与密集和多样化的(海绵特异性)微生物群落(海绵特异性)[2,3]的共生,有助于它们在几乎所有深度和纬度上茁壮成长的能力。内膜,可以占据海绵体积的>50%[4],作为海绵的能量来源,并提供一个多样化的代谢物和代谢通路托盘,有利于海绵(审查在[2])。海绵及其内质同质体产生的一类突出的代谢物是脂质。对海绵的脂质分析始于20世纪70年代[5、6],由脂肪酸(FAs)的多样性和独特结构激发,其中存在广泛的评论[7-9]。海绵的特点是存在不寻常的多不饱和,长链(≥24碳(C))FAs(LCFAs),具有典型的Δ5,9不饱和(称为"脱振酸",因为它们在演示波氏体[5,10]中首次发现)。这些LCFA是海绵膜磷脂(PLs)的重要组成部分,可能起到结构和功能作用[11]。海绵,由于其内分泌物,富含细菌性FAs与高多样性,不仅包括常见的等位素(i)a)分支的FAs,而且更不寻常的。典型的演示海绵是大量中链分支 FAs (MBFAs),这些 FAs 被认为是由海绵特异性桉菌[12]产生的,并且存在分支的 LCFA[12,13]。由于分支假设是由微生物而不是海绵宿主引入的,分支LCFA的存在提供了关于内分泌物和宿主之间生物合成相互作用的信息[12,14]。莫诺尼奇法,例如.C16:1ω7,丰富的细菌[15],已被确定为LCFA的前体与ω7配置[16]。因此,不饱和的位置也为细菌-宿主生物合成相互作用提供了见解。

此外,海绵FA的组成可能具有分类价值,至少在更高的分类水平(例如.class水平),因为德莫斯蓬吉亚,六氯苯二角('玻璃'海绵),卡尔卡雷亚和人形体有明显的FA配置文件[17]。然而,较低分类级别的化学轴经济学值是有争议的,因为组成可能会随着环境条件而改变[18]。海绵的FA成分,特别是结合(自然丰度)稳定的同位素分析,已经显示出一个有价值的工具,推断海绵的饮食信息,如喂养珊瑚粘液[19],浮游植物[20]和甲烷固定内膜[21]。

北大西洋是广阔的海绵地的家园,沿着大陆架、海山和深渊平原22,23)广泛存在海绵地。Geodiidae和其他海绵物种的秩序特特拉蒂内利达(类演示)是这些海绵的理由的主要成分,占海绵地面底栖生物量的>99%[23-25]。Geodiidae spp.是高微生物丰度 HMA) 海绵,它们含有丰富、多样化和特定的微生物群落(细菌和古生物),参与多个生物地球化学过程,如G中所示。巴雷蒂[26]。这反映在G的足协组成中。以细菌法斯[12]为主的巴雷蒂 包括占总法斯 [12]28%的独特 Mbfas 。然而,其他地理迪达的足协档案还没有在文献中描述。

在这项研究中,我们分析了五个常见的深海特特拉蒂内利德的FA概况,这些特征来自北大西洋不同温度的组合:北极海绵地面组合,可容纳G。帕尔瓦 G.亨切利斯特拉塔·斯普(如S.哈菲迪奥波拉)居住在温度低于3\u20124°C,和北部组合容纳G。巴雷蒂G.大西洋等,通常发现温度在3°C以上[23,27]。基于LCFA中的化学结构和分支的存在,我们提出生物合成途径,并表明这些途径与C同位素(δ13C) LCFA 和细菌前体的签名。作为LCFAs前体的前体的高丰度内膜标志表明,这些深海海绵使用其内膜作为代谢源。

方法

海绵系列

在不同的科学考察中,在北大西洋由遥控飞行器(ROV)和箱芯收集,在北大西洋收集了德莫斯蓬吉亚类(Tetractinellida)类常见的生境建造海绵。G. atlantica (n = 2) 标本于 2017 年 8 月与挪威研究船 G.O. Sars (64°42'N 7+59'E) 一起在苏拉礁上采集,深度为 266+2012295 米。G.巴雷蒂(n = 6) 个人在 2018 年 8 月 G. O. Sars 探险中从巴伦支海 (70°47N 18+03'E) 获得约 300 米水深 [2018 年 8 月 [28]。挪威的研究考察不需要在该地区采集样品的特别许可证。在同一次探险中G.亨切利 G.帕尔瓦斯特莱塔拉菲迪奥罗拉(所有n = 1) 收集在 550\u2012600 米深度舒尔茨银行 (73°50°N, 7°34°E)[29]G.亨切利(n = 3), G.帕尔瓦(n = 3) 和S.2016年10月,德国研究船"极地"号(AWI远征PS101)在距离朗塞斯岭690~u20121000米深度的北极探险中检获了哈菲迪奥波拉(n =2)标本。 位于永久覆盖的北极中部(从 87°N, 62°E 到 85°55'N 57°45'E)。在国际水域采集样品不需要特别许可证。在G.O.Sars探险期间采集的海绵立即在船上被解剖,从朗塞斯岭采集的海绵被冻结在-20°C,并在实验室中被解剖(冷冻)。来自单个海绵随机部分的子采样n = 3)被冷冻干燥,研磨以获得细粉末。舒尔茨银行和巴伦支海的海绵粉状子样本被混合,以获得具有物种代表性的样本,同时对海绵内部的亚样本进行了分析,以了解朗塞斯岭样本。朗塞斯岭的代金券标本存放在挪威卑尔根大学。G的凭证标本。巴雷蒂G.大西洋储存在荷兰阿姆斯特丹大学,舒尔茨银行的凭证标本存放在荷兰特塞尔的荷兰海洋研究所。

脂质提取和 FAME 准备

每次提取时,每块海绵的海绵粉量约为100毫克。海绵脂被提取与修改的布莱和戴尔协议[30],这是在 NIOZ 耶塞克[31-33]开发.由于毒性较低,我们调整了此协议,用二氯甲烷 (DCM) 取代氯仿。整个协议可在线获得dx.doi.org/10.17504/protocols.io.bhnpj5dn。简言之,海绵组织样品在滚筒桌上用溶剂混合物(15 mL甲醇、7.5 mL DCM 和 6 mL 磷酸盐 (P)缓冲器 (pH 7–8) 提取至少 3 小时。通过添加 7.5 mL DCM 和 7.5 mL P 缓冲器实现了层分离。已收集 DCM 层,其余解决方案已用 DCM 第二次清洗。合并后的 DCM 分数被蒸发以获得总脂质提取物 (TLE),随后进行了称重。TLE 的一个别名通过激活的二氧化硅柱被分成不同的极性类。TLE 首先用 7 mL DCM(中性脂质)进行稀释,然后是 7 mL 丙酮(糖脂)和 15 mL 甲醇(磷脂)。用于进一步分析的磷脂 (PL) 部分使用碱甲基化 (使用甲醇中的甲氧氧化钠与已知δ转化为脂肪酸甲基酯 (FAMEs)13C). 建议对复杂的脂质混合物进行碱性甲基化[34]。甲基化后,法米被收集到六烷中,并浓缩到~100微L六烷用于气相色谱 (GC) 分析。

在这项研究中,每个物种选择两个单独的海绵样本进行详细分析。FAME 样本的阿里报价用于使用二甲基二硫化物 (DMDS) 去皮化[35]进行双重债券鉴定。样品在 50 °C、50μL DMDS 和 10 μL 60 毫克/mL I 中隔夜反应在 40°C2.通过添加 200 μL 六烷和 200 μL Na 来阻止反应2S2啊3.收集了六烷层,用水相用六烷洗了两次。合并的六烷部分燥,随后在一个小纳上擦干2所以4在DCM中使用的列:甲醇(9:1)去除任何水,并在GC-vial中重新溶解在六烷中,用于GC分析。另一个FAME样本的引用用于使用亚当斯催化剂(PtO)催化氢化进行甲基分支鉴定2)和氢气。每个 FAME 样本,溶解在 ~3 mL 乙酸乙酸酯中,10-30 毫克 PtO2和一滴醋酸,用氢气冒泡至少1小时,之后反应小瓶被关闭,并在室温下搅拌过夜。随后,在由 MgSO 组成的小柱子上对每个样本进行了纯化4(底部) 和娜2CO3(上图)使用DCM,在乙酸乙酸乙酸乙基中重新溶解后进行分析。

名气分析

用火焰电阻探测器 FID) (HP 6890 系列) 在气相色谱仪 (GC) 上对法米进行分析,以进行浓度和 GC 质谱测量 (MS) (芬尼根跟踪 GC Ultra), 以在非极性分析列 (安捷伦, CP-Sil5 CB; 25 m x 0.32 mm x 0.12 μm) 上进行识别。样品被冷落。GC 烤箱的编程速度为 70°2012130°C,最低为 20°C,随后为 4°C/min 至 320°C,其保持 20 分钟。GC–FID 的运行压力为 100 kPa,而 GC–MS 的运行速度为 2.0 mL min-1.MS 以全数据采集模式运行,扫描m/z 50–800 中的离子。这13C/12通过分析 GC 燃烧同位素比质谱仪 (IRMS) 上的重复样本,确定各个 FAME 的 C 同位素比率,该质谱仪由 HP 6890N GC (惠普) 组成,通过 III 型燃烧接口 (热芬尼根) 连接到 Delta-Plus XP IRMS,使用与 GC-MS 相同的 GC 列和设置。

保留时间根据 C 的保留时间转换为等效链长度 (ecl)12:0, C16:0,和C19:0家庭。C19:0FAME还用于量化单个FAME的浓度(微克g)-1DW)[36]δ13GC-C-IRMS 获得的 C 值已更正甲基化剂添加的 C 原子。这些数据在 R[37]中用 R 包 RLims[36]进行分析和绘制。

结果

G的脂质产量。巴雷蒂 G.亨切利格帕瓦S。嗜血杆菌相似,大约是干重的2-3%(DW)。只有G.大西洋的脂质产量较低,约为DW的1.6%。PL 衍生的 PL (PLFA) 配置文件类似于 TLE 的配置文件,大多数 FA 似乎都存在于PL(S1 表[38] 中)。估计PLFA总含量为6.7±6.3毫克g-1DW (0.7%)(n=16,跨越所有物种)。使用 TLE 进行识别比较困难,因为 LCFA 与固醇共同使用,因此 PLFA 色谱用于识别和组成分析。

鉴定

单个 FA 的化学结构通过保留时间 (ecl)、解释其质谱和/或使用 NIST 库进行识别来识别。这些分配通过参考混合物(西格玛·奥尔德里希的细菌和一般FA混合物)和文献比较(例如NIOZ耶塞克[31]的参考ecl列表)进行了验证。

FA 以 ω 和Δ (IUPAC) 注释的形式呈现,以避免不含糊性,并以混合形式呈现,这是海绵 LCFA 注释的典型[17,39] 1)。不饱和被描述为 Cx:y, 其中 x 是 C 原子的数量, y 是双键的数量, 其次是Δ和所有双债券头寸从卡盒酸结束在Δ符号, 和甲基 (终端) 的第一个双债券的位置结束在 ω 符号 ( 1, 1 。根据IUPAC符号的甲基分支被描述为y-Me-Cx, y 是从车箱酸末端分支的位置, x 是骨干处的 C 原子数, 不包括分支 ( 1 ω符号遵循IUPAC的MBFAs术语,但偏离了最终分支的FAs。倒数第二个(ω2)和倒数第二个甲基分支(ω3)用ω符号描述为等离子(i-C)x)和前人(a-C)x其中 x 是 C 原子的总数,包括分支( 1,1)。

· 原始图像

FA 名称以 ω 和Δ符号和混合形式命名,具有相应的总 C 原子 (C) 和等效链长 (ecl)。FA 类别与图2的类别匹配。仅显示具有丰度≥1%的 FAs(至少在一个物种中)。粗体数字≥总FA的10%。

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0241095.t001

极性列上的排列顺序由靠近功能组的甲基分支的 FAME 组成,首先进行,然后是末端(倒数第二个)分支等位( i ,ω1)和笔倒数第二个前 a ,2ω) FAME ,最后是不饱和的 FAME ,其中最接近功能组的不饱和度首先被清除。分支不饱和的FAMEs在分支直FAM和直FAME之前,最后用相同的C数字(2,1)。

2.从演示海绵G中提取的 FAME 分数的 GC 跟踪。来自朗塞斯岭(北极中部)的亨切利

LCFA 等位素经常共同稀释或至少没有很好地分开,如 C 的 PLFA 配置文件所示26:2Δ5,9和C26:2Δ9,19.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0241095.g002

分支的位置也用MS光谱得到验证,因为i分支的特点是更强烈的[M-43]碎片离子和A分支的特点是[M-57]的升高碎片离子。通过类似于[12]的诊断质量片段确定饱和 MBFA 中的甲基分支位置。m/z 171、185、199 和 [185]213 的相对强度用于识别 8、9、10 和 11-Me 分支的相对贡献S1 表)。由于 11-Me 分支产生 m/z 185 和 213 的等等片段,因此 m/z 185 (213–185) 的超额片段是由 9-Me 分支S1 表[12]产生的。在未饱和的 MBFA 中,使用类似的诊断片段和饱和的 FAMES1 表 进行分支。++

使用 DMDS 进行治疗后,对不饱和位置进行了识别,DMDS 与单不饱和的 FAMEs 直接进行。然而,对于多不饱和的FAME,由于 S(-Me) 广告的多种可能性,与 DMDS 的识别变得复杂。The Δ5,9不饱和,典型的海绵LCFAs,在C形成循环硫化物6和C9位置与甲基锡奥组在C5和C10与DMDS脱毛后的位置。此外,产品由 C 的甲基锡欧组组成5和C6和C的(未反应的)双重债券9和C10反之亦然[40]。这对于识别典型Δ很有用5,9配置在海绵[41]。当不饱和是相距甚远时,即位置Δ9,19和Δ11,21,两种双键都转换为二甲基二硫化物介导体(质量谱的S1无花果)。基于 ecl 和 DMDS 和氢化的组合,我们确定了分支单体和死气酸 FAs。

脂肪酸成分

北极物种G.亨切利 G.帕尔瓦 S.哈菲迪奥波拉)舒尔茨银行和朗塞斯岭有一个类似的PLFA配置文件S1表),所以我们汇集了来自两个位置的组成数据(1)。这些数据标准化为 PFA 总量的百分比(以下简称 FAs),以便于比较,但实际 FA 浓度 (μg g)-1DW)可在S1 表中找到。

细菌脂肪酸。

细菌性FAs,包括分支和单一的FAs,链长n = 19)(1,3),最多可代表79±2%(在S。哈菲迪奥波拉)。

细菌法(蓝色)、海绵LCFAs(橙色)和其他FAs(绿色)对每个物种的总PLFA的平均贡献(缩写为1)。

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0241095.g003

MBFAs主导了所有深海演示海绵物种的FA配置文件(1,2),其中最丰富的是Me-C18:0(12+23%,1),分支在9,10,11,占优势的位置11(m/z [213×185];平均49%),其次是位置10(m/z 199;平均37%)。 第二最丰富的法斯是梅 - c16:0(8~14%的足协,1),分店在8、9、10、11,占9位m/z 185:平均36%)和10(m/z 199:平均33%)。此外,我-C14:0,我-C15:0,和梅-C17:0存在,但在低得多的丰度(≤3%的总FAs为每个表1)。其他分支(饱和)FAs发现在所有演示,但不太丰富,包括i-C15:0(13-我-C14:0)和a-C15:0(12-我-C14:0),占每个FA总数的2-5%,和i-C17:0(15-我-C16:0)和a-C17:0(14-我-C16:0),每个(1)的1%至2%不等。

在深海演示波格中发现了多个单体 FAs。最丰富的是C16:1(从 G 的 9% 不等。大西洋14%在G。帕瓦S.rhaphi二磷,由不同的异位体组成,双键为ω5、ω7、ω9和ω11位置。C 的伊索默斯18:1双债券在ω7,ω8,ω9,ω11,ω12,ω13,ω14和ω15职位占总FAs的4-7%。ω7不饱和度在C中占主导地位16:1和C18:1DA1.此外,罕见C16:1和C18:1在演示波格中发现了带有甲基分支的 FAs。C 中的主导不饱和16:1是 ω7 和氢化 FAME 样本表示i 分支i-C17:1ω7(15-我-16:1Δ9)在北方物种中占4-5%(G.巴雷蒂 G.大西洋)北极物种<2%(G.亨切利 G.帕尔瓦 S.哈菲迪奥波厦门论文发表-)( 1 1 C 中最丰富的不饱和度18:1法斯是 ω12 (Δ6)为G。帕尔瓦 G.亨切利S。拉菲迪奥波拉 ω14 (Δ4)为G。巴雷蒂G.大西洋,和Me组是在链的中间,因为没有增加的峰值为i-a-C19:0在相应的氢化分数中发现。中间我分支C18:1等位器(我-C18:1ω4和我-C18:1ω12)在所有演示海绵物种中被发现,范围在2-5%(1)之间。此外,金额低(< 1%)C15:1和非分支C17:1被发现。

其他脂肪酸。

线性法主要为C14:0, C16:0和C18:0在所有物种(1)。海绵只含有少量的 FAs,C 之间的链长20和C24,如C20:5ω3(<所有物种的1%)和C22:6ω3 (1.4 ± 0.9%, n = 8) 在北方物种G.大西洋G.巴雷蒂<1%的北极物种G。亨切利 G.帕瓦S.拉菲迪奥波拉.

海绵脂肪酸。

LCFA (≥ C24),典型的海绵,每个物种不同,由24-29C原子组成(1)。LCFA 代表 21 ± 6%n = 19, 在所有物种中), 贡献最高 (29%)在G.大西洋 3 。演示波的最常见的不饱和是Δ5,9,但也不饱和在Δ9,19和Δ11,21被观察到。

· C25 G.占主导地位的 Lcfa 。帕尔瓦23-我-C24:2Δ5,9 (i-C25:2Δ5,9),其次是22-我-C24:2Δ5,9 (a-C25:2Δ5,9),占15±1%的FAs。伊索默斯 23 - 我 - c24:1Δ17 (i-C25:1ω7)和(中)我-C24:1Δ17(我-C24:1ω7)存在于北方物种G.大西洋G.巴雷蒂)共代表 2 ± 0.6% ( 1.

· C26 G.占主导地位的 Lcfa 。亨切利C26:2Δ9,19,其次是C26:2Δ5,9,他们共同代表了该物种中14±6%的FAs。巴雷蒂G.大西洋也合成了C26:2Δ5,9和C26:2Δ9,19按可比金额计算G.加起来占11±1%。巴雷蒂7%在G。大西洋。跟踪金额(<1%)C26:2Δ5,9在G.帕瓦S.拉菲迪奥波拉.同样,C的微量26:2Δ11,21(<1%)是在G.帕尔瓦

· C27:(中)我-C26:2Δ5,9北方物种丰富G.巴雷蒂 4 ± 3%:G.大西洋 9%) 。也25-我-C26:2Δ5,9 (i-C27:2Δ5,9),和25-我-C26:2Δ9,19 (i-C27:2Δ9,19)是由北方物种生产的,加起来占G类动物总数的3±2%。巴雷蒂5%在G。大西洋。由于这些峰值共同发音,单个浓度可能代表同位体混合物。G.亨切利拥有少量的 (中) Me - c26:2Δ5,9和25-我-C26:2Δ9,19 (i-C27:2Δ9,19)(<2%)。同样S.拉菲迪奥波拉有低量的(中)我-C26:2Δ5,9和 (ai -C27:2Δ5,9(共 2%, 1)。

· C28 G.大西洋 G.巴雷蒂G.帕瓦包含C28:2与Δ11,21配置,占1.8±1%的总FAs在G。巴雷蒂 1.9% 在G.大西洋3.6±1.7%。 帕尔瓦R.嗜血性磷含有少量的 C28: 2Δ5,9(1.5 ± 0.4%)(1

· C29 占主导地位的LCFA在S.拉菲迪奥波拉 (中) - 我 - C28: 2Δ5,9贡献率为5.5±总FAs贡献率为0.6%(表1)。

稳定 C 同位素值 (δ13C)

· 稳定 C 同位素值 (δ13占统治地位的 FAs 的 C)范围在 -18 ‰ (95 百分位) 和 - 26 ‰ 厦门论文发表-5 百分位) 之间,并在所有演示海绵( 4 2)中表现出类似的模式。δ13占主导地位的 Mbfas 的 C 值, Me - c16:0,我-C18:0,还有我-C18:1ω12(和ω14)丰富13C 与其他细菌脂肪酸相比,a (i)- C15:0, C16:1ω7, C18:1ω7)(4,2)。最耗竭的法是i -c17:1ω7 (-25.7 ± 1.3 ‰ δ13C)。 不同的LCFA异构体被分析为一体,因为异构体在GC(2)上共同发音或至少没有很好地分离。但是,我们可以为a)i-C分配单独的同位素值27:2 and Me-C26:2 (4)。与细菌性FAs相比,LCFA显示的同位素变异较小,但仍在-25至-19‰(5-95百分位)(4,2)之间。梅 - c26:2和 (ai -C27:2有相对相似的δ13C 值,-20 和 -21 ‰,在G. .巴雷蒂G.在氢化样品中观察到-21和-24‰的更显著差异(每个物种1),表明峰值重叠模糊了同位素值。

4。δ13C 在分析演示波格中前体和主导 LCFA 的组成。

海绵物种被聚集在一起,中间点在框图中表示为黑线。这些数字描绘了样本大小(个人名声样本)。这些颜色用于将细菌前体 FAs 与海绵生成的 LCFA 进行匹配。粉红色用于(中)我分支的FAs,灰色用于线性法,蓝色和黄色表示a)i分支的FAs具有独特的δ13C 可能最终在异位混合物中,由绿色表示(见图5,了解生物合成通路)。

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0241095.g004

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讨论

细菌法斯

在分析的所有五个海绵物种中都发现了高浓度的MBFAs等位混合物,而与物种和位置无关(1)。MBFAs的占主厦门论文发表-导位被认为是Demosponiae的一个典型特征,因为它在任何其他生物体、沉积物或水中都没有观察到[12,17,42]。分支的典型位置在 ω5 和 ω9[12]之间, 导致 8 - 和 9 - me - c 的主导地位16:0和10-和11-我-C18:0在这项研究中,与先前报告的MBFA[43,44]一致。MBFAs通常由细菌产生,因此它们大概是由独特和海绵特异性细菌共生体制成的。据推测,这些细菌在地质学上很普遍,是在现代海洋环境中独特的海绵宿主的保护环境中遗传的[8,12]。这一假设得到了Geodia sp.的基因组分析的进一步支持,揭示了地理变化很小的物种之间类似的微生物群落[45]。

MBFAs的候选植物是波里布菌,这是HMA海绵中独特而丰富的植物46),因为MBFA浓度和波里巴菌丰度在几种海绵物种[44]之间发现了正相关关系。元基因组分析表明,波里布菌是G.巴雷蒂[47,48],但很少, 甚至缺席在G.亨切利[49] 这表明在G中也丰富的脂肪菌, 酸菌, 氯氟西和蛋白菌的统治地位.巴雷蒂[4748]。这表明,MBFA要么属于上述植物之一,要么MBFA在微生物植物中共享,因为与基因组分析相比,MBFA的化学轴化学分辨率较低。在环境中,MBFA主要存在于氮和硫减少剂(化学异种)和氧化剂(化学自动营养素),它们大多是(大型)蛋白酶家族的成员[50-53]。氮、硫的减少和氧化过程是在深海海绵(如G)中进行的。巴雷蒂[265455]和氧化过程与 CO 耦合2固定,虽然相关的CO2固定可能占深海海绵碳需求的10%<[56]。海绵中的毛躁菌也被描述为混合营养细菌,能够修复CO2使用古老的木材–隆达尔(反向乙酰-CoA)通路[57]。MBFAs中的同位素浓缩(4,2)同意先前对G的观察。巴雷蒂[58],因此可能与氮和硫转化过程和潜在的 CO 有关2固定。这将是有趣的执行同位素跟踪研究[56]13C-CO2评估CO2加入丰富的MBFAs,可能与硝化(或硫氧化)抑制剂结合,类似于Veuger等人[59]。

最耗竭的法i- c)17:1ω7, 4 2 被认为是减少硫磺细菌脱硫的化学轴化学标记[60]i-C之间的同位素差异17:1ω7和MBFAs表明,这些标记不是来自同一个微生物联合体。更普遍的细菌标记(例如a)i-C15:0,典型的克阳性细菌和C16:1ω7和C18:1ω7,典型的一般克阴性细菌[15]有中度δ13C 值 ( 4 2)。这种值可能是来自不同途径的同位素平均值的结果,因为它们是更一般的细菌标记,或者它们可能代表有机物上的一般异质性,具有δ13C 值从 -24 到 -22 ‰在北极西部[61]

具有 C 链长度的 FAs 贡献率低20到C24典型的浮游植物和浮游动物(例如.C20:5ω3和C22:6ω3) 表明,厦门论文发表- 下沉的动物园和浮游植物对海绵饮食贡献不大, 至少不是直接的。这些发现支持越来越多的证据表明G.巴雷蒂(和其他北大西洋深海海绵)主要以溶解的有机物、中上层和相关细菌[62,63]为食。因此,部分细菌法可能来自中上层细菌,而不是细菌内膜,尽管与细菌共生体数量高(10)相比,这一贡献预计较低11细胞mL海绵-1[62])。浮游植物标记在北方地理学(G.大西洋G.巴雷蒂)与北极物种(1)相比,可能与水深有关,因为从约300米和600米以下的北极物种中采集了北方物种,而环境因素,如永久冰覆盖(朗塞斯岭)和北极一般较低的初级生产,与北大西洋北部64米)相比,可能起着主要作用。

细菌法斯(在所有五个分析的深海演示海绵物种中占总法斯总数的56-79%)的总体高丰度符合它们作为HMA海绵的分类,支持微生物内生体在海绵代谢中起关键作用的想法[2,3]。值得注意的是,内分泌体的贡献可能更高,因为没有通过(PL)FA分析[65]检测到古生物,同时在G中也发现它们非常丰富。巴雷蒂[4748]

海绵LCFA

虽然在研究的特特拉西内利德物种中,细菌FA特征非常相似,但海绵特异性LCFA成分更具有物种特异性。LCFA 的主要不饱和度是Δ的双倍不饱和5,9在所有被分析的物种中的位置,这是演示海绵的典型特征[510]。同样,线性 C26:2Δ5,9,(a)i-C25:2Δ5,9和/或i-C27:2Δ5,9,存在于所有分析的物种(5,1),是演示海绵的常见LCFA,(例如[17,39,66],概述见[8])。我们发现(中)我分支的Δ5,9除G.帕瓦 5 1 厦门论文发表-。此外,蒂尔等人[17]G.巴雷蒂和其他一些德莫斯蓬吉亚 哈利洛纳sp.,彼得罗西亚sp.), 但不是在所有分析德莫斯蓬吉亚。我们还确定了新的LCFA:i-C 27:2Δ9,19(在G.大西洋,G.巴雷蒂G.亨切利)和Δ11,21在C26:2和C28:2 (巴雷蒂G.帕尔瓦)。Δ的存在11不饱和(C)26:2Δ11,21和C28:2Δ11,21),通过DMDS脱毛识别,在海绵LCFA中并不常见。巴纳森等人[67]发现Δ11一系列单一FAs中的不饱和,包括C28:1,在热带演示海绵物种(订单阿西内利达),但没有与Δ的死气流长的LCFA11到目前为止,已描述了不饱和。配置表示Δ11脱盐酶可能活跃在这些物种中;然而,这种酶在海绵中的活性尚未报告。

·

5.在检查的特特拉蒂内利德物种中,建议将(微生物)前体的生物合成途径带到LCFA。

在研究的海绵中检测到的 FAs 以黑色矩形显示,实心箭头表示拉长,破折号箭表示Δ5,9不饱和。包含每个 LCFA 的物种都标明了 1中的缩写名称,粗体名称意味着 LCFA 在该特定物种中占主导地位。

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0241095.g005

G.大西洋G.巴雷蒂有几乎相同的LCFA配置文件(1),表明这些物种可能是密切相关的,正如早些时候建议基于他们的固醇和氨基酸成分[68],但偏离分子植物学,使他们进一步分开[27]。G FA 概况 。亨切利G相似。巴雷蒂G.大西洋和基于分子现象学G。亨采利G的姊妹物种。巴雷蒂。然而G.与其他地理学、i-和a-C相比,帕瓦产生了不同的LCFA 25:2Δ5,9这个物种在植物学上也与其他地理学的片段[27]不同。ai 分支C 的主导地位25:2已发现在另一个地理迪达家族(吉奥迪内拉[69]。最后,也S.拉菲迪奥波拉产生了一个独特的LCFA,我-C28:2Δ5,9, 一个 Lcfa, 已经描述了家庭的演示[13,43]

阿特海绵地面的三个占主导地位的特拉蒂内利德G.亨切利 G.帕瓦S.拉菲迪奥波拉)产生不同的LCFA(1),可以作为化学轴化学标记。这些海绵的形态非常相似,因此LCFA分析提供了识别每个物种的额外方法。此外,独特的LCFA可以作为营养标志,研究深海海绵在环境中的生态作用。没有发现北极特特拉蒂内利德LCFA成分的地理差异S1表),表明环境对LCFA成分的影响有限,这是使用LCFA作为化学轴化学标记的先决条件。

突出海绵脂肪酸的生物合成通路。

LCFA中识别分支可以识别其短链前体和生物合成途径。各种体内结合研究与放射性基板[16,39,66,70]证明, 海绵拉长 FA 前体, 在卡盒酸末端添加 2 个 C 原子, 在Δ5和Δ9(可视化在[10]),揭示 C16:0作为共同C的前身26:2Δ5,9,而C16:1ω7被确定为C的前体26:2Δ9,19 ( 5.没有证据表明分支是由海绵引入的,所以i-a-C15:0被确定为i-和a-C的前体27:2Δ5,9 ( 5[39],而我-C16:0已确定为Me-C的前体26:2Δ5,9和我-C28:2Δ5,9 ( 5[131671] 。最后,我们假设i-C17:1ω7是i-C的前身25:1ω7和i-C27:2Δ9,19在G.大西洋,G.巴雷蒂G.亨切利 5

应用于本研究表明,大多数LCFA可以通过既定途径与前体相连,具有假设的中间体,因为几乎没有发现任何可检测的丰度(5)。细菌前体的C同位素差异(部分)反映在LCFAs的C同位素组成(4,2),尽管与前体相比,CFA中的C同位素差异并不明显。一种解释是,宿主使用C源的混合物来拉长LCFA的前体,同时方法学方面也可能有所贡献。(更长的)分析列可能有助于改善LCFA的分离。

5的构图显示在海绵脂研究中同时使用 ω 和Δ (和混合) 节点的好处。来自终端端的注释 (ω 和a) i符号 1)便于显示生物合成通路,因为这些位置不会随着拉长而改变 5)。然而,典型的Δ5,9不饱和更方便显示与Δ注释,因为一个ω符号会随着不同的C链长度(5)而改变。模棱两可产生于甲基分支的 ω 符号, 因为a (i)符号用于最终分支 FAs,并描述总 C 原子(包括甲基组),而"我符号"用于 MBFAs,并描述骨干(不包括甲基组)的 C 数,并计算从卡盒酸末端(而不是终端 (ω) 端( 1)的分支位置。这可能会导致对总 C 数的混淆,而 C 数是纠正额外甲基组测量同位素值所必需的,以及不饱和(从骨干末端开始计数,不包括甲基组)和从 ω 转换为Δ符号 ( 1) ω 位置。我们添加了此讨论以创建意识,并建议在方法中包括符号的描述,并在使用符号样式的混合物时同时呈现两个命名。

结论

在这项研究中,我们确定了北冰洋-北冰洋深大西洋中突出的栖息地建设演示(订单Tetractinellida)的FAs。所有被调查的五个物种都主要含有细菌性FAs,特别是MBBAs(Me-C)的异位混合物16:0和我-C18:0)(合计>20%的FAs)。与线性和(前)异位分支的FAs相比,MBFA具有同位素丰富性。海绵生产的LCFA,链长为C24-C28是线性的,中和a(i)分支,主要是典型的Δ5,9饱和。他们还生产(尚未描述)分支和线性LCFA,并Δ9,19和Δ11,21不饱和,即i-C27:2Δ9,19, C26:2Δ11,21,和C28:2Δ11,21.G.帕瓦S.拉菲迪奥波拉各自产生了不同的LCFA,而G.大西洋,G.巴雷蒂G.亨切利有一个类似的LCFA配置文件,虽然每个物种有不同的主要。北大西洋深海演示海绵的典型 FA 轮廓可用作化学轴和营养标记。我们建议从其细菌前体中获取占主导地位的LCFA的生物合成途径,这些途径得到了LCFA中小同位素差异的支持,支持海绵从其内生菌中获取积木的想法。

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C 的 DMDS 行为的质谱26(a,b)和C28(c,d)Lcfa 与Δ9,19(a,c) 和Δ11,21(b,d) 不饱和。

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0241095.s001

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S1 表。所有脂肪酸组成数据。

此卓越文件包含脂肪酸数据 μg g DW)-1和个别标本的相对丰度(%),在PL和TL中。卓越文件还包含我分支 C 的片段16和C18,氢化样品中饱和(分支和线性)法梅的相对位置和同位素数据。

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0241095.s002

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确认

我们感谢安杰·博提乌斯支持和推动这项研究并组织PS101。我们感谢PS101的船长和船员在海上给予的出色支持。我们感谢已故的汉斯·托雷·拉普(UiB)组织了G.O.Sars探险和出色的项目协调。我们感谢戴斯蒙德·艾夫廷的分析帮助。我们感谢硕士生吉多·盖耶尔、肖恩·霍特杰斯、大卫·兰克斯、地板威利和费姆克·范·达姆在实验室和分析方面所做的帮助。我们感谢伊娃·德·里杰、萨米拉·阿布萨拉和斯特凡·舒滕在协议制定方面所做的帮助。艾琳 · 里普斯特拉和沃尔克 · 蒂尔因在法身份识别方面提供帮助而得到承认。我们感谢彼得·范·里伊斯维克和马可·胡特卡默分享他们的分析知识和身份识别库。帕科·卡德纳斯因分享他的分类学知识而得到认可。我们感谢吉尔斯·巴纳森和一位匿名评论者对他们的建设性评论。

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