免费医学论文发表-血穆洛尼念珠菌复合体,热带地区新出现的威胁?
抽象
背景
血穆洛念珠菌复合体相关种属是与耳念珠菌密切相关的致病酵母,具有内在抗真菌耐药性,但流行病学数据很少。
方法/主要发现
我们分析了C引起的真菌血症患者的临床和人口统计学特征。血木复合体及相关物种(C.假血腥,C.外阴)2002-2021年在法国报告,并将其与C的数据进行了比较。副孢霉菌血症,因为它们都可以是皮肤的共生体。我们还对C定植的成年住院患者和门诊患者进行了一项研究。2014-2020年在马提尼克岛大学医院管理的Haemulonii综合体。最后,我们对C引起的真菌进行了文献综述。Medline (1962–2022) 中报告的血木罗尼复合体和相关物种。
我们总共确定了28种由C引起的真菌。法国的血穆洛尼复合体。这些发作通常与细菌感染(38%)和高死亡率(44%)有关,并且与C不同。热带真菌病主要起源于加勒比海和拉丁美洲。所有分离株均显示对两性霉素B和氟康唑的体外敏感性降低。在马提尼克岛,我们发现皮肤定植在社区人群中很常见,而定植与ICU患者中异物的存在密切相关。文献综述确定了274例真菌发作,其中56次是单独描述的。与我国的系列病例一样,已公布的病例主要来自热带地区,粗死亡率很高。
结论/意义
多重耐药C。血穆洛尼复合体相关物种在社区和医院环境中造成真菌和定植,特别是在热带地区,需要更密切的流行病学监测,以防止潜在的C。灵气般的威胁。
作者摘要
C的酵母。血穆洛尼复合体(C.严格意义上的血腥,C.杜布沙穆洛尼,C.海穆洛尼变种脆弱)及相关物种(C.假性血木罗尼和C.外阴)在系统发育上接近耳念珠菌,但它们的分布、病理生理学和抗真菌耐药性谱知之甚少。这项工作提供了法国这些酵母的第一个流行病学数据。由这些酵母菌引起的真菌血症主要在热带海外地区(法属西印度群岛、法属圭亚那)发现,并发生在有念珠菌血症危险因素的患者中,尤其是皮肤入口。这项工作突出了这些酵母在这些热带地区的皮肤携带,以及它们在外来装置中殖民的能力。与念珠菌副瘟病一样,导管是真菌病的主要途径,但C酵母的死亡率似乎更高。血穆洛尼复合体及相关。它们通常对许多抗真菌药物表现出体外耐药性,特别是氟康唑和两性霉素B,它们在世界范围内仍经常用作念珠菌血症的一线和二线治疗。文献综述的结果与这些总体结果一致。这些观察结果证明有必要在有关地区进行更密切的流行病学监测,以防止潜在的C。灵气般的威胁。
数字
Table 2Fig 3表1图1图2Table 2Fig 3表1图1图2
引文: 弗朗索瓦丝·乌, 德斯诺斯-奥利维耶 M, 勒戈维奇 Y, 西特邦 K, 瓦伦蒂诺 R, 佩格尼 S, 等. (2023) 血穆洛尼念珠菌复合体,热带地区新出现的威胁?公共科学图书馆 Negl Trop Dis 17(7): e0011453. https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011453
编辑 器: 约书亚·诺桑丘克,阿尔伯特·爱因斯坦医学院,美国
收到: 15月 2023, 9;接受: 2023月 31, 2023;发表: <>月 <>, <>
版权所有: ? 2023 弗朗索瓦丝等人。这是一篇根据知识共享署名许可条款分发的开放获取文章,该许可允许在任何媒体上不受限制地使用、分发和复制,前提是注明原作者和来源。
数据可用性: 对于来自RESSIF和YEASTS网络的数据,本出版物使用的数据被视为假名个人数据。因此,GDPR 以及有关数据保护的法国法律适用于此数据集的使用。对于数据访问请求,请求者可以联系: NRCMA负责人范妮·兰特尼尔(Fanny Lanternier)cnrma@pasteur.fr 应告知请求者,访问和重复使用此数据集需要获得 (i) 法国监管机构关于数据保护的授权 (CNIL) 和 (ii) 法国主管伦理委员会 (CESREES) 的伦理意见 有关马提尼克岛大学医院的数据 访问大学医院的数据的马提尼克岛可以向该机构的数据保护官 (DPO) 申请:dpo@chu-martinique.fr。
资金: 这项工作得到了法国公共圣公会(UF,MDO,YLG,KS,RV,SP,TC,EM,AP,MN,NDG,OL)和巴斯德研究所(UF,MDO,YLG,KS,RV,SP,TC,EM,AP,MN,NDG,OL)的支持。资助者在研究设计、数据收集、分析或数据解释方面没有任何作用。
竞争利益: 提交人声明不存在相互竞争的利益。
介绍
自2010年代以来[1],多重耐药耳念珠菌[2]凭借其在假肢材料上存活并在患者之间传播的能力,已成为一种传播的医疗相关真菌[3-5]。在梅奇尼科科分支中,血穆洛念珠菌复合体的酵母(C.严格意义上的血腥,C.海穆洛尼变种脆弱,和C.杜布沙木罗尼),C.假血穆洛尼和C.外阴在系统发育上与C密切相关。耳廓和几个共同的致病性相关性状,如对假体材料的粘附[6,7]表型转换[8]和多重耐药性[7,9-11]。事实上,即使数据库更新,生化方法的错误识别也很常见[12]。少数病例 C.自报道以来,已有血霉菌复合体感染的报道[13,14],但自2000年代以来,已有几种真菌感染的报道,尤其是在热带地区[10,15-17]。这些酵母菌通常对氟康唑的MICs含量较高[18],氟康唑是许多低收入国家治疗真菌的一线抗真菌药,并且对两性霉素B的敏感性降低,通常用作挽救疗法。这种复合物的分离物通常对棘白菌素敏感,但已从人类样本中分离出耐棘白菌素的菌株[19]。
在法国,稀有酵母占真菌的近7.4%[20],但没有针对这种复合物的主要流行病学研究。因此,血穆洛念珠菌复合体相关物种引起的真菌病的危险因素和临床结局在很大程度上仍不为人知[21]。
在此背景下,我们在法国大陆和法国海外领土进行了一项研究,包括(i)由C引起的真菌病的流行病学。血木罗尼复合体,C.假性血木罗尼和C.Vulturna(以下简称“真菌系列”),(ii)将这些真菌与C引起的真菌进行比较的病例对照研究。副孔病,一种皮肤共生,以及 (iii) 马提尼克岛重症监护室 (ICU) 住院门诊和住院患者的定植研究。最后,我们对过去六十年中由这些物种引起的真菌进行了文献综述。
方法
道德声明
真菌系列是根据法国法律和赫尔辛基宣言(2000年通过)进行的,并得到了法国真菌研究小组科学委员会的批准。根据法国法规,对NRCMA的监督得到了巴斯德研究所机构审查委员会#1(#2009-34 / IRB)和“国家信息与自由委员会”的批准。马提尼克岛的研究已获得马提尼克大学医院IRB的批准(#2020/064)。
法国真菌病的流行病学
我们收集了与C引起的真菌病相关的临床资料。血木罗尼复合体,C.假性血木罗尼和C.来自两个法国数据库的vulturna,从创建到31圣2021 年 2002 月。这两个项目都是由法国国家侵袭性真菌病和抗真菌参考中心(NRCMA)发起的:YEASTS监测计划于27年启动,巴黎地区的22所大学或癌症医院参与[2012],以及法国侵袭性真菌感染监测网络(RESSIF)计划,于29年启动,来自法国大陆和海外的20家医院参与[<>]。
病例对照研究
上述系列报告构成病例总体。我们选择了由C引起的真菌。来自RESSIF数据库的副硅样作为对照人群,而不是C。白色念珠菌,因为初步信息揭示了人类皮肤上存在这些研究物种。
马提尼克岛的殖民化
我们招募了含有C的样本的患者。2014 年 2020 月至 48 年 <> 月期间,马提尼克岛大学医院的 haemulonii 复合酵母菌被认为是非致病性的(即不对感染负责)。我们保留了涉及假定为社区获得性定植的成年患者(称为“门诊患者”,包括住院<<>小时)或在ICU住院的患者。临床医生根据临床背景和采样来源保留缺乏致病性。
文献综述
我们从1月<>日开始对Medline数据库进行了文献综述圣从1962年到1月<>日圣,2022 年,所有字段中的搜索词如下:“血性念珠菌”或“血性环状念珠菌”或“双布沙穆洛念珠菌”或“假性血马念珠菌”或“外阴念珠菌”。我们纳入了所有报告的C病例。血木罗尼复合体,C.假血穆洛尼和C.通过测序鉴定外阴真菌病,可获得个体临床信息和/或对抗真菌药的敏感性。
分离表征
风化系列。
C的所有血流分离株。如前所述,使用V1D/LS5和NL8/NL2引物对核糖体DNA的ITS1-2.9S-ITS266和D1/D4区域进行测序,在NRCMA鉴定了血穆洛尼复合物和相关物种[23]。使用EUCAST发布的肉汤微量稀释法(v 7.3.2自22年2020月24日起生效)进行对米卡芬净、两性霉素B和氟康唑的抗真菌敏感性试验,并对米卡芬净培养基进行了如前所述[<>]。
马提尼克岛的殖民化。
从2014年到2017年,通过在显色培养基chromID念珠菌琼脂(BioMerieux,Marcy l'étoile,法国)上培养,结合API ID32C系统的碳同化测试(BioMerieux,Marcy l'étoile,法国)来鉴定酵母。由于没有与复合物匹配的 API 代码,因此通过将谱图与先前通过测序鉴定的分离株的内部数据库的谱图进行匹配来进行菌株鉴定。此外,碳同化鉴定不能区分复合物内的物种,分离物被鉴定为C。血木复合物相关酵母。
自 2017 年以来,使用 Biotyper 系统(布鲁克达尔托尼克斯,美国马萨诸塞州比勒里卡)通过基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 常规进行物种鉴定。重新检查了2017年之前分离的1株菌株,显示与生化分析没有差异(S25表)。尽管如此,由于区分C.严格意义上的血木洛尼和C。海穆洛尼变种目前,如果没有测序,就不可能出现脆弱性[26,<>],仅通过MALDI-TOFMS鉴定的此类分离株被认为是C。血腥病或C.杜布沙木蕨。
Statistical analysis
Analyses were performed on isolates from single episodes of fungemia, each isolate corresponding to a single patient. Associated factors were studied according to the species. We selected the variables significantly associated with any of the two groups at the threshold p<0.20. We developed an explanatory model using logistic regression, with a manual stepwise procedure guided by the Akaike Information Criterion. Explanatory model results were reported as adjusted odds ratios (aOR) with 95% confidence intervals (95%CI). Data were analyzed using R software (version 4.0.2). The map was created from a fla-shop.com background map (https://www.fla-shop.com/svg/, CC BY 4.0 license) modified with inkscape software.
Results
Fungemia series
Between October 1st, 2002, and July 31st,2021年,在YEASTS和RESSIF报告的12 032例念珠菌血症事件中,有28例(0.23%)是由C引起的。血木罗尼复合体,C.假血穆洛尼,或C。外阴(表1)。发病率似乎随着时间的推移而增加(S1图),15年至28年间报告了53/6(2017.2021%)病例。来自法属西印度群岛和法属圭亚那的通知占所有病例的71.4%(20/28)。
缩略图 下载:
.PPT幻灯片
.PNG大图
.TIFF原始图像
表 1. C引起的真菌病患者的特征。血木罗尼复合体,C.假性血木罗尼和C.2002 年至 2021 年间法国的 vulturna(酵母和 RESSIF 计划)和 C.2012 年至 2021 年间法国的副硅病 (RESSIF)。
https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011453.t001
受试者大多是男性(16,57.1%),中位年龄为67岁(四分位距(IQR)= 46-72);其中81.4%的人生活或曾经住在热带地区。92例患者(9.32%)至少有以下一种合并症:实体癌、血液系统恶性肿瘤、近期外科手术、中心静脉导管、细菌感染背景、ICU住院;其中1例(<>.<>%)至少存在其中三种合并症。
确定了四个不同的物种。严格意义上的血穆洛尼念珠菌是优势种(16,57.1%),其次是C。杜布沙穆洛尼(8,28.6%)和C.外阴(3,10.7%)。假血穆洛尼梭菌一次被鉴定(1,3.6%),而没有发现C.海穆洛尼变种漏洞被找回。物种的分布因年龄而异,C的中位年龄为67岁和70岁。血木罗尼和C.Dubushaemulonii分别为46岁和27岁。假性血木罗尼和C.分别是外阴。
在因C.Vulturna,2人有癌症史并预先暴露于伏立康唑,46人最近接受过手术。唯一的C。假性血穆洛尼病发作发生于一名来自巴西的 <> 岁女性,她在法属圭亚那因胃炎住院。她没有细菌合并感染或近期手术。
诊断后 3 个月的全因死亡率为 44% (11/25),其中 7 例 (63%) 发生在前 30 天,5 例 (45%) 发生在前 15 天内。死亡率随着年龄的增长而增加,从<3岁年龄组的27%(2.67%)增加到≥57岁年龄组的1.67%。尽管没有抗真菌治疗,但仍有两名患者存活下来。他们年龄在30岁以下,没有基础疾病,并受益于及时更换导管。
抗真菌药敏试验可对23/28菌株进行。两性霉素 B 的中位 MIC 值很高,尤其是 C 的 MIC 值。杜布沙穆洛尼(2毫克/升)。相反,氟康唑的C组较低。杜布沙穆洛尼,但仍然很高(16毫克/升)。所有菌株的micafungin的MIC中位值为≤0.250 mg / l(图1)。
缩略图 下载:
.PPT幻灯片
.PNG大图
.TIFF原始图像
图1. 对法国真菌系列菌株的抗真菌药的敏感性概况。
通过EUCAST肉汤微量稀释参比方法。C. duobushaemulonii = 7, C.严格意义上的血木罗尼=13,C。外阴 = 3。粗体黑条:MIC 值中位数;蓝色菱形:平均麦克风值。
https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011453.g001
病例对照研究
2012年至2021年间,942集C.在RESSIF数据库中宣布成人副瘟菌病(表1)。患者在海外领土的地理位置与C的发生显著相关。血穆洛尼复合物相关物种真菌(aOR = 70.77,95%CI = 23.67–280.01),其次是细菌感染的背景(aOR = 2.91,95%CI = 1.10–7.64)(图2A)。
缩略图 下载:
.PPT幻灯片
.PNG大图
.TIFF原始图像
图2. 真菌血症发生和死亡率的解释模型。
一个。C发生的解释模型。血木罗尼复合体,C.假性血穆洛尼或C.外阴真菌而不是C。副硅斑病(根据具有 95% 置信区间的逻辑回归系数调整比值比)。b.C在3个月内死亡的解释模型。血木罗尼复合体,C.假血腥,C.外阴或C。副孢霉菌(从逻辑回归系数调整比值比,置信区间为 95%)。
https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011453.g002
三个月全因死亡率主要与重症监护管理和基础合并症有关(图2B)。在调整了患者的合并症、细菌感染的存在和护理水平后,C的致命结局往往更常见。血木苣苔复合物相关种真菌比C.副硅虫病真菌病(aOR = 2.39,95%CI = 0.95–5.86)。
马提尼克岛的殖民化
我们确定了119 C。血穆洛尼复合体定植,在116名成人中具有可查阅的医疗记录(S2图)。在门诊患者的87例定植(表2)中,61例(70.1%)为皮肤定植,12例(13.8%)为眼科定植。
thumbnail 下载:
.PPT幻灯片
.PNG大图
.TIFF原始图像
表 2. C.2014年至2020年期间马提尼克岛大学医院的血穆洛尼复合体定植。
https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011453.t002
皮肤定植门诊患者主要是女性(41/61,67.2%);平均年龄为61.3岁;所有人都住在马提尼克岛,24.6%(15/61)失业。他们的主要合并症是糖尿病(12,19.7%),实体癌(12,19.7%)和免疫缺陷或免疫抑制治疗(分别为6,9.8%和5,8.2%)。在68.9%(42/61)的病例中可以鉴定复合体内的物种:32例(76.2%)的C。血穆洛尼,17 (40.4%) C.杜布沙木苣苔,7只(16.6%)同时拥有这两个物种。值得注意的是,C.在27个(44.3%)这些样本中同时发现了副硅病。三名患者相隔2个多月提供了1个阳性样本,但我们不能断言它们是同一物种。
眼科定植患者多为女性(7/12,58.3%);平均年龄为35岁;所有人都住在马提尼克岛,除了戴隐形眼镜(100%)外,没有合并症。所有患者均因铜绿假单胞菌或茄蜡菌复合体而患有角膜炎或角膜脓肿。
ICU组的17名受试者(表2)大多数是男性(13/17,76.5%),平均年龄为62.3岁,完全居住在西印度群岛。主要合并症是糖尿病(4,23.5%),上个月的手术(4,23.5%)和最近接触抗真菌药物(6,35.3%)。中位住院时间为15天。最具代表性的标本是从呼吸道分离的(12,70.6%),包括对插管患者进行的10个(83.3%)。C. haemulonii 和 C.Dubushaemulonii同样频繁,一名患者具有混合定植。值得注意的是,C.在这些样本中还有5个(29.4%)发现了副硅病。在筛查多重耐药细菌的12例患者中,5例(41,6%)呈阳性。3个月时的粗死亡率为47.1%。
文献综述
检索产生了来自274个国家的14种真菌(图3),其中218种被排除在外,主要是由于缺乏个人数据(S3图)。最终,选择了56个案例;所有这些都发生在 2006 年至 2022 年之间。病例主要来自热带地区(44/56,78.6%)(S2表)。我们对两个年龄组进行了个体化:中位年龄为19.3岁的儿童(n = 5)(IQR = 0.1-5)和成人(n = 13),中位年龄为66岁(IQR = 52-82)。在成年人中没有性别优势。与我们的真菌系列一样,严格意义上的血穆洛念珠菌是主要物种。在成虫中,物种分布因年龄而异,C的中位年龄为79岁。严格意义上的血木罗尼与C的56、49和59岁相比。杜布沙穆洛尼,C.海穆洛尼变种脆弱,和C.分别是假血糜。年龄已知仅为一例C。外阴(83岁)。
thumbnail Download:
PPTPowerPoint slide
PNGlarger image
TIFForiginal image
Fig 3. World mapping of cases of fungemia due to C. haemulonii complex, C. pseudohaemulonii or C. vulturna.
According to our case series (obtained from the YEASTS program 2002–2021 and the RESSIF Network 2012–2021) and the literature review (Medline, 1962–2022). References are with the S3 Fig. Map created from fla-shop.com (https://www.fla-shop.com/svg/, CC BY 4.0 license) modified with inkscape software.
https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011453.g003
虽然文献中既往抗真菌暴露比我们的系列研究更频繁,但药敏特征相似,两性霉素B和氟康唑的MIC值较高(S4图)。两性霉素B的MIC中位值较高,尤其是C。假性血穆洛尼(32毫克/升)C.外阴(8毫克/升)和C。杜布沙穆洛尼(4毫克/升)。氟康唑的MIC中值较高,尤其是C。血穆洛尼复合酵母(64毫克/升)。4株菌株的米卡芬净MIC值为3 mg/l,所有其他菌株的MIC值为≤0.500 mg/l。
在所有病例中,粗死亡率很高(5/12,41,7%),与我们的真菌系列相当,尽管大多数文章中没有指定死亡时间。
讨论
我们报告了由C的多种耐药酵母引起的大量真菌和定植。血穆洛尼复合体,或非常密切相关的物种(C.假性血木罗尼和C.外阴)和C的病例对照研究。副硅病作为参考。因此,我们报告了C的第一批病例。自2016年在东南亚报道以来,南美和欧洲的外阴真菌病[11]。这也是最重要的文献综述,其中包含由这些酵母引起的真菌的个体数据,并被分子证明可以避免错误识别。
考虑到我们的系列,这些罕见的真菌尤其存在于热带地区。事实上,在RESSIF和/或YEASTS项目的中心中,只有9个报告了C。血穆洛尼复合物相关物种真菌血症;其中,3个声明中心位于热带地区,占整个系列的20/28(71.4%)。到目前为止,生活在热带地区是与这些酵母而不是C引起的真菌发生最相关的因素。副瞳孔病。
在我们的系列研究中,92.9%的患者表现出与C相当的危险因素。副孢菌病真菌血症,也与其他地方观察到的真菌血症相对应[27]。相比之下,在我们的病例系列研究中,唑类药物预暴露并不常见(16.6%),但通常认为这是非白色念珠菌血症的重要因素[28,29]。中心静脉导管的高发生率 (68.2%) 和无消化外科部位感染表明皮肤是 C 的来源。血穆洛尼复合物相关种念珠菌血症。我们关于皮肤定植以及这些病原体在假体材料上形成生物膜的能力的结果也支持了这一点[6,7]。
由C引起的真菌血症。血穆洛尼复合酵母菌和相关物种似乎发生在有皮肤相关真菌血症风险的患者中,主要发生在热带地区。C.在马提尼克岛的社区和ICU中,副霉菌和携带研究使我们能够假设这些真菌在热带地区很常见,不是因为特定的宿主特征,而是因为这些酵母在环境中造成的负担,这有利于门诊和住院患者的携带。
C的广泛抗真菌耐药性。血穆洛尼复合物相关物种使它们可能难以治疗。虽然没有临床断点或ECOFF,但两性霉素B、氟康唑和其他唑类药物的MIC值特别高,表明对这些抗真菌药具有内在耐药性。正确识别C。血穆洛尼复合物相关物种不仅与流行病学监测相关,而且还具有直接的治疗影响,两性霉素B对C的体外活性特别低。杜布沙穆洛尼和C.例如假性血霉菌分离株[30]。与之前发表的一些研究不同[10,15,16],我们系列研究中似乎没有死亡归因于治疗失败,即使是接受氟康唑或伊曲康唑治疗的3例患者(其菌株氟康唑的MIC值极低(≤16mg/L)。
我们的系列研究(44%)和文献综述(46%)的全因死亡率相似。如导管相关念珠菌血症所示,快速控制皮肤入口可能在预防死亡方面发挥重要作用[31,32]。
在马提尼克岛,可能还有在拉丁美洲和加勒比其他地区,C的皮肤殖民。存在血穆洛尼,尤其是在医院环境之外。这与它的兄弟物种C形成鲜明对比。耳神,通常表现为纯院内酵母[3]。相隔一个多月采样的三名皮肤标本呈阳性的患者使我们怀疑慢性定植。在我们的研究中,除了真菌血症外,没有观察到深层次感染。此外,所有眼科样本阳性的患者均佩戴隐形眼镜,ICU的10例呼吸道定植患者中有12例进行了插管,这一事实提示异物定植[3]。
我们的研究有几个局限性。缺失的数据,特别是最古老的病例,影响了我们的结果。我们明显无法检索血培养的阳性时间、系统导管移除的确认以及血培养灭菌所需的时间。此外,没有报告皮肤真菌映射,排除了皮肤定植假说的确认。
然而,根据我们的研究,住院或来自热带地区的患者的血培养中存在酵母菌,特别是如果出现中央静脉导管,应提示C的诊断。血穆洛尼复合物相关酵母菌真菌血症,如副念珠菌病。这种情况需要管理感染的入口,并加强棘白菌素概率治疗的效用。尽管缺乏具体的临床试验,但仍有一些体外和动物数据[33]以及唑类或两性霉素B治疗失败的病例报告[10,15]证明使用棘白菌素类药物作为一线治疗是合理的。当无法通过MALDI-TOFMS进行快速鉴定时,显色培养基培养的特定方面可能足以支持诊断[34]。该策略可以限制适当治疗开始前的延迟,这与念珠菌血症的死亡率密切相关[31,35]。水平传播能力,特别是在医院,已经从涉及C的疫情中得到建议。血穆洛尼复合体[15,36]。这些酵母的出现也在基因组水平上得到支持:C共享的特征。奥里斯和C.血木罗尼复合体相关物种(同源,相似基因家族扩增)表明这些物种的生态学和生理学相似,并且它们也可能成为危险的病原体[37]。
历史上被描述为温暖的海洋酵母[38],C.血木罗尼复合物相关酵母后来被确定为热带水生和陆地环境的腐生菌[39-41],例如C。在菲律宾,外阴花已从热带花卉中分离出来[11],并且是某些动物物种的潜在病原体[9,42]。一些国家最近报告了新生儿科病例,表明这些酵母存在于人工环境中。虽然我们的系列研究没有流行事件的证据,但其他作者报告了一系列聚集性病例[15,30],与C的克隆相同。假性血痣,增加了院内传播的可能性。因此,在这些多重耐药酵母群体中出现流行克隆的情景是相当可信的[30],就像C一样。自 2010 年代以来描述的 AURIS 医疗保健相关爆发。
Conclusion
Fungemia caused by C. haemulonii complex and related species yeasts are rarely observed in France and occur mainly in overseas tropical territories. These environmental yeasts colonize the skin of general population, as well as medical devices, favoring skin-related fungemia in patients with risk factors. These multi-drug resistant yeasts share numerous characteristics with C. auris, and deserve to be known and monitored.
Supporting information
Bar plot representing the temporal distribution of C. haemulonii complex, C. pseudohaemulonii and C. vulturna fungemia (YEASTS and RESSIF databases).
Showing 1/7: pntd.0011453.s001.pdf
Skip to figshare navigation
1 / 7
下载
无花果分享
S1 图 表示血穆洛尼梭菌复合体、假血穆洛尼梭菌和外阴梭菌真菌的时间分布的条形图(酵母和 RESSIF 数据库)。
https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011453.s001
(英文)
S2 图 2014 年至 2020 年间在马提尼克大学医院(法属西印度群岛)分离的被认为是非致病性的血穆洛尼梭菌复合酵母阳性培养样品的流程图。
https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011453.s002
(英文)
S3 图 来自 MedLine 的血穆洛尼梭菌复合体、假血穆洛尼梭菌和外阴梭菌真菌病例综述病例流程图(1962-2021 年)。
https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011453.s003
(英文)
S4 图 文献综述(MedLine 1962–2022)、微量稀释(n = 36)或商业方法(n = 16)或未指定(n = 1)的菌株的敏感性概况。
https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011453.s004
(英文)
S1 表。 MALDI-TOF MS 确认最初通过 API ID32C 鉴定的血木梭菌复合体菌株(法国马西星星贝奥梅里埃)并储存在马提尼克岛大学医院。
https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011453.s005
(英文)
S2 表。 文献综述中发现的关于真菌的患者和菌株的特征,以及通过分子测序鉴定的血穆洛尼梭菌复合物或相关酵母真菌的个人数据(MedLine 1962-2022)。
https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011453.s006
(英文)
S1 致谢。 为数据做出贡献的法国真菌病研究小组的成员按城市的字母顺序排列。
https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0011453.s007
(英文)
引用
1.佐藤 K, 牧村 K, 莲见 Y, 西山 Y, 内田 K, 山口 H. 念珠菌属Nov.,一种从日本医院住院患者的外耳道分离出的新型子囊菌酵母。微生物免疫。2009;53: 41–44.
查看文章谷歌学术搜索
2.查巴内 F, 格拉夫 A, 杰基尔 L, 科斯特 AT.新发病原体耳念珠菌抗真菌耐药机制研究进展.前微生物。2019;10: 2788.
查看文章谷歌学术搜索
3.Sabino R,Veríssimo C,Pereira áA,Antuness F. Candida auris,医院相关疫情的代理人:我们需要考虑哪些具有挑战性的问题?微生物。2020;8.密码:32012865
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
4.范沙尔克维克 E, 姆彭贝 RS, 托马斯 J, 舒平 L, 伊斯梅尔 H, 洛曼 W, 等.由耳念珠菌驱动的念珠菌血症的流行病学转变,南非,2016-2017。新兴感染病 2019;25: 1698.
查看文章谷歌学术搜索
5.世卫组织真菌重点病原体清单,以指导研究、开发和公共卫生行动。 世界卫生组织;25 十月 2022.可用: https://www.who.int/publications/i/item/9789240060241
查看文章谷歌学术搜索
6.拉莫斯LS,奥利维拉SSC,苏托XM,布兰奎尼亚MH,桑托斯ALS。血穆洛念珠菌复合物中的浮游生长和生物膜形成概况。医学真菌. 2017;55: 785–789.
查看文章谷歌学术搜索
7.Ramos LS, Oliveira SSC, Silva LN, Granato MQ, Gon?alves DS, Frases S, et al.血穆洛念珠菌复合体的表面、粘附性和毒力方面。医学真菌. 2020;58: 973–986.
查看文章谷歌学术搜索
8.邓 Y, 李 S, 冰 J, 廖 W, 陶 L. 血霉念珠菌的表型转换和丝状化,一种新兴的人类机会性病原体。微生物光谱。2021;9: e0077921.
查看文章谷歌学术搜索
9.森德哈斯-布埃诺 E, 科莱卡 A, 阿拉斯特鲁伊-伊斯基耶多 A, 泰伦 B, 格罗内瓦尔德 M, 科斯特热瓦 M, 等.将血穆洛尼念珠菌i复合体重新分类为血穆洛尼念珠菌(C.血穆洛尼I组)、C.杜布沙木洛尼属2012月。(血木苜蓿II组)和C.海穆洛尼变种脆弱的变种50月:三种多重抗性人类致病酵母。临床微生物学杂志。3641;3651: <>–<>.
查看文章谷歌学术搜索
10.Kim M, Shin JH, Sung H, Lee K, Kim E, Ryoo N, et al. 韩国 5 所大学医院的血穆洛念珠菌和密切相关物种:鉴定、抗真菌敏感性和临床特征。临床感染 2009.第E57-E61页。密码:19193113
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
11.Sipiczki M, Tap RM. 念珠菌 pro tempore sp.nov.,一种与从花和临床样本中分离的血性念珠菌属复合物相关的二态酵母物种。国际 J 系统 Evol 微生物学。2016;66.密码:27411802
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
12.Ambaraghassi G, Dufresne PJ, Dufresne SF, Vallières é, Mu?oz JF, Cuomo CA, et al.使用更新的 Vitek 2 酵母鉴定系统鉴定 8.01 版鉴定耳念珠菌:多实验室评估研究。临床微生物学杂志。2019;57.密码:31413079
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
13.Lavarde V., Daniel F., Saez H., Arnold M. 和 Faguer B. Peritonite mycosique à Torulopsis haemulonii.Bull Soc Fr Mycol Med. 1984;13: 173–176.
查看文章谷歌学术搜索
14.Marjolet M. Torulopsis ernobii, Torulopsis haemulonii: levures opportunistes chez l'immunodéprimé?Bull Soc Fr Mycol Med. 1986;15: 143–146.
查看文章谷歌学术搜索
15.可汗祖, 阿尔斯韦纳, 艾哈迈德 S, 阿尔卡泽米 N, 汗 S, 约瑟夫 L, 等.由对两性霉素 b、伊曲康唑和氟康唑耐药的血穆氏念珠菌引起的新生儿真菌病暴发。临床微生物学杂志。2007.第2025-2027页。pmid:17428940
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
16.阮世英, 郭永伟, 黄春桐, 许薛萍萍.血穆洛念珠菌引起的感染:物种鉴定、抗真菌敏感性和结局。国际 J 抗菌剂。2010.第85–88页。密码:19786341
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
17.科尔多瓦 S, 维沃特 W, 博斯科-博尔赫特 ME, 塔韦尔纳 C, 苏斯 W, 穆里森戈, 等.从血培养物中分离的酵母的物种分布和敏感性概况:阿根廷一项多中心主动实验室监测研究的结果。阿金特微生物学牧师。2011;43.密码:22430989
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
18.Desnos-Ollivier M, Lortholary O, Bretagne S, Dromer F. Azole 对属于 9 种常见和稀有物种的 000,40 多种临床酵母分离株的敏感性概况。抗菌剂化疗。2021. pmid:33820766
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
19.穆罗MD,德阿劳霍莫塔F,汉堡M,德阿泽维多梅洛AS,达拉-科斯塔LM。来自儿科患者的两种血穆洛尼念珠菌分离株的棘白菌素耐药性。临床微生物学杂志。2012;50: 3783.
查看文章谷歌学术搜索
20.布列塔尼 S, 西特邦 K, 德斯诺斯-奥利维耶 M, 加西亚-埃尔莫索 D, 莱舍尔-布鲁五世, 卡萨英 S, 等.提高对侵袭性真菌病的认识的主动监测计划:法国RESSIF网络(2012年至2018年)。唰。2022;13: e0092022.密码:35499498
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
21.布列塔尼 S, 雷诺达特 C, 德斯诺斯-奥利维耶 M, 西特邦 K, Lortholary O, 德罗默 F, 等.基于详尽监测计划(2002-14)的不常见酵母菌种相关真菌血症的诱发因素和结果。抗菌化疗杂志。2017.第1784–1793页。密码:28333259
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
22.布列塔尼 S, 德斯诺斯-奥利维耶 M, 西特邦 K, Lortholary O, Che D, Dromer F, et al.氟康唑与棘白菌素替代治疗作为一线治疗对酵母菌流行病学没有影响(医院驱动的主动监测,2004-2017,法国巴黎)。前沿医学 2021;8:641965。
查看文章谷歌学术搜索
23.Desnos-Ollivier M, Bretagne S, Boullié A, Gautier C, Dromer F, Lortholary O. Isavuconazole 29种导致侵袭性感染的酵母菌种的MIC分布(2015-2017)。临床微生物感染。2019. 第 634.e1–634.e4 页。密码:30771532
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
24.Desnos-Ollivier M, Bretagne S, Lortholary O, Dromer F, French Mycoses Study Group.2,787 种酵母分离株的棘白菌素敏感性模式:检测 FKS 突变阈值的重要性。抗菌剂化疗。2022;66: e0172521.密码:35412354
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
25.Grenfell RC, da Silva Junior AR, Del Negro GMB, Munhoz RB, Gimenes VMF, Assis DM, et al.血穆洛尼念珠菌复合体的鉴定:使用 ClinProTools 克服布鲁克生物型机、Vitek MS IVD 和 Vitek MS RUO 数据库的局限性。前微生物。2016. pmid:27379069
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
26.Isla G,Taverna CG,Szusz W,Vivot W,García-Effron G,Davel G.阿根廷感性念珠菌:阿根廷敏感性特征确定的最新情况和文献综述。2017年,Curr Fungal Infect Rep.第203-208页。
查看文章谷歌学术搜索
27.Lortholary O, Renaudat C, Sitbon K, Desnos-Ollivier M, Bretagne S, Dromer F, et al.念珠菌血症的风险和临床结局取决于潜在的恶性肿瘤。重症监护医学 2017;43:652–662。密码:28321466
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
28.周JK, 戈兰 Y, 鲁萨泽 R, 卡奇默 AW, 卡梅利 Y, 利希滕贝格 D, 等.重症监护病房中非白色念珠菌属与白色念珠菌引起的念珠菌血症相关因素。临床感染病 2008;46: 1206–1213.
查看文章谷歌学术搜索
29.荣格 DS, 法马基奥蒂斯 D, 姜 Y, 塔兰德 JJ, 康托伊扬尼斯 DP.癌症患者中不常见的念珠菌属真菌,美国德克萨斯州休斯顿。新兴感染病2015年。密码:26488845
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
30.盖德 L, 穆尼奥斯 JF, 谢思 M, 瓦格纳 D, 伯科 EL, 福斯贝里 K, 等.了解多重耐药念珠菌的出现:使用全基因组测序来描述血穆洛尼念珠菌物种复合体的种群结构。前热内特。2020;0.pmid:32587603
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
31.Andes DR, Safdar N, Baddley JW, Playford G, Reboli AC, Rex JH, et al.治疗策略对念珠菌血症和其他形式的侵袭性念珠菌病患者结局的影响:随机试验的患者水平定量评价。临床感染 2012.第1110-1122页。密码:22412055
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
32.Kollef M,Micek S,Hampton N,Doherty JA,Kumar A.念珠菌感染引起的脓毒性休克:经验性治疗和感染源控制的重要性。临床感染病 2012;54: 1739–1746.密码:22423135
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
33.席尔瓦 LN, 坎波斯-席尔瓦 R, 拉莫斯 LS, 特伦廷 DS, 马塞多 AJ, 布兰奎尼亚 MH, 等.血穆洛尼念珠菌复合物在梅洛氏拱廊中的毒力和经典抗真菌药物的疗效:与其他临床相关的非白色念珠菌物种的比较研究。FEMS 酵母研究 2018;18.密码:30052907
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
34.de Jong AW,Dieleman C,Carbia M,Mohd Tap R,Hagen F.与其他市售制剂相比,两种新型显色培养基用于鉴定耐多药念珠菌的性能。临床微生物学杂志。2021;59.密码:33536293
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
35.Garey KW, Rege M, Pai MP, Mingo DE, Suda KJ, Turpin RS, et al.开始氟康唑治疗的时间会影响念珠菌血症患者的死亡率:一项多机构研究。临床感染 2006.第25-31页。密码:16758414
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
36.拉莫斯 R, 卡塞雷斯 DH, 佩雷斯 M, 加西亚 N, 卡斯蒂略 W, 圣地亚哥 E, 等.巴拿马医院中新出现的多重耐药念珠菌感染:实验室监测和准确识别的重要性。临床微生物学杂志。2018;56.pmid:29695521
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
37.Mu?oz JF, Gade L, Chow NA, Loparev VN, Juieng P, Berkow EL, et al.对耳念珠菌和相关新兴物种的多药耐药性、交配和毒力的基因组见解。纳特公社。2018;9.pmid:30559369
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
38.无范乌,麦克· 规格,一种来自大西洋的酵母。安东尼·范·列文虎克。1962;28.pmid:14039875
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
39.Ferreira N,Belloch C,Querol A,Manzanares P,Vallez S,Santos A.从巴西木薯根中分离的酵母微生物群落:基于分子鉴定的分类学分类。当前微生物。2010;60.密码:19924478
查看文章PubMed/NCBI谷歌学术搜索
40.帕加尼 DM, 海德里希 D, 保利诺 GVB, 德奥利维拉阿尔维斯 K, 达尔本 PT, 德奥利维拉 CF, 等.从巴西珊瑚礁的软珊瑚中分离的血穆洛尼念珠菌和皮肤孢菌的抗真菌剂的敏感性和酶活性。拱形微生物。2016;198: 963–971.
查看文章谷歌学术搜索
41.Tra Bi CY, N'guessan FK, Kouakou CA, Jacques N, Casaregola S, Djè MK. 鉴定从科特迪瓦生产的拉菲草酒(Raphia hookeri)中分离的酵母,并通过PCR间三角洲对酿酒酵母菌株进行基因分型。世界微生物生物技术杂志。2016;32: 1–9.
查看文章谷歌学术搜索
42.Loosová G, Jindrák L, Kopácek P. 在 Ornithodoros moubata (Acarina: Argasidae) 成虫中由酵母菌血穆洛尼实验性感染引起的死亡率。叶寄生虫。2013;48: 149–153.
查看文章谷歌学术搜索