回顾2022年
乔安娜·克拉克 ，代表PLOS生物学工作人员编辑
发布时间：2022 年 12 月 16 日
随着 2022 年即将结束，我们回顾了 PLOS Biology 最近发生的一些变化，重点介绍了过去一年中生命科学领域编辑最喜欢的一些时刻，并感谢我们的编辑、作者和同行评审员。
引文： 克拉克 J，代表 PLOS 生物学工作人员编辑 （2022） 反思 2022 年。公共科学图书馆生物学20（12）： e3001957. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3001957
发表： 12月 16， 2022
版权所有： ? 2022 克拉克，代表 PLOS 生物学工作人员编辑。这是一篇根据知识共享署名许可条款分发的开放获取文章，该许可允许在任何媒体上不受限制地使用、分发和复制，前提是注明原作者和来源。
资金： 作者没有为这项工作获得具体资金。
竞争利益： 我已阅读该期刊的政策，本手稿的作者有以下相互竞争的利益： 作者是公共科学图书馆的现任带薪雇员。
PLOS Biology的编辑是Ines Alvarez-Garcia，Joanna Clarke，Kris Dickson，Richard Hodge，Paula Jauregui，Nonia Pariente，Roland Roberts和Lucas Smith。
由于许多原因，2022 年将是值得纪念的一年。乌克兰战争、世界大片地区生活成本上涨以及持续的 COVID-19 大流行及其所有影响在过去一年中蒙上了阴影，但也有理由抱有希望。联合国海洋大会以几项承诺和行动承诺结束，这些承诺和承诺非常重要，尽管没有就化石燃料的使用达成必要的协议，但 COP27 至少以富裕国家的协议结束，向受气候相关灾害影响最严重的国家提供补偿。在生命科学的其他地方，环境DNA打开了一扇通往过去的窗户，使我们能够重建古老的生态系统，人工智能使我们能够预测几乎所有已知蛋白质的结构，并且在该领域的争议之后[1]，试验结果表明，一种新的抗淀粉样蛋白药物可能最终能够减缓阿尔茨海默病的认知能力下降。
在PLOS Biology，2022年也带来了一些变化。我们的编辑委员会发展到包括来自29个国家的263名学术研究人员，我们告别了25位学术编辑，并欢迎了72位新编辑。我们的神经科学编辑加布里埃尔·加斯克（Gabriel Gasque）也遗憾地离开了我们，在 protocols.io 担任了一个令人兴奋的新角色。代替他，我们欢迎Kris Dickson加入团队，她带来了有关科学出版和神经科学各个方面的丰富知识。我们也很幸运地接待了Suzanne de Bruijn作为编辑实习生。您可以在她为PLOS Biologue撰写的博客文章中了解更多关于她与我们一起经历的信息，该博客今年还主持了最近发表的研究的作者的新系列“论文背后”博客文章，讲述了将他们的研究项目推向新方向的曲折故事。
2022 年的另一个重大变化是我们的杂志部分。我于 2022 年初加入该期刊，担任杂志部分编辑，并喜欢掌握我们在观点、社区页面、论文和未解之谜中涵盖的各种主题。今年，我们发布了第一篇共识观点，这是杂志版块的新文章类型。这些文章就生命科学界广泛感兴趣的主题提供了指南或建议，到目前为止，包括各种主题，如人类健康最佳光照水平的建议[2]，以及授权早期职业研究人员改善研究文化的方法的想法[3]。
作为杂志版块的编辑，我也有幸监督旨在提高对特定事件或问题的认识的特别文章集。2022 年，我们出版了一本关于孟德尔在现代遗传学中的遗产的合集，以纪念 200千格雷戈尔·孟德尔诞辰，以及一系列关于可持续、健康和包容性未来的海洋解决方案，以探索潜在的解决方案，以根据联合国海洋十年来减轻人类活动对海洋生态系统的影响。我们已经计划在 2023 年推出一些令人兴奋的系列，所以请关注这个空间！
除了推出一种新型杂志文章外，2022 年还发布了我们的第一篇预注册研究文章（PRA，也称为注册报告）[4]。对于这些文章，同行评审分为两个阶段;一个发生在实验进行之前，另一个发生在数据分析和论文写好之后。希望这种方法将提高研究质量，减少对出版物中“华而不实”结果和讲故事的关注。今年，我们发表了关于决策[5]和脊髓损伤[6]的PRA，并希望在不久的将来看到更多使用这种方法的生命科学研究发表。
2022 年也恢复了亲自参加会议。作为编辑，我们特别高兴能够在如此长的休息时间后再次与研究人员面对面交流，并赶上我们各自领域令人兴奋的新发展。也就是说，虚拟会议出席对我们来说也是一个福音，使我们能够涉足不熟悉的话题，并向来自全球科学会议代表性不足的研究人员学习和互动。我们在 2022 年参加了大约 40 次会议，并正忙于规划 2023 年的会议时间表，因此请在您可能参加的会议上留意我们。
最后但并非最不重要的一点是，2022 年发表了一些优秀的科学。我们从今年挑选了一些我们最喜欢的PLOS生物学论文作为一些推荐阅读，以帮助您度过新的一年（框1）。
方框1.2022 年 PLOS 生物学编辑精选
卢克·史密斯（干细胞生物学、神经变性、生理学、表观遗传学和昼夜节律）
我的选择是Curreli等人的“海马星形胶质细胞中空间信息的互补编码”[7]。这项研究有助于一项新兴的工作，表明星形胶质钙信号传导可能调节神经元功能和动物行为，作者报告说星形胶质细胞钙信号在虚拟空间导航任务中编码空间信息。这一研究表明，信息编码超越了神经元回路，看到进一步的工作梳理出星形胶质细胞中的编码如何以及是否调节行为和电路活动将是令人兴奋的。
Roli Roberts（遗传学，进化生物学，生态学，行为学和元研究）
我的选择是Filbee-Dexter等人的“由于加速分解，海带碳汇势随着变暖而降低”[8]。作者将标准化的海带网袋运送到北半球的12个不同地区，并测量了分解速率及其与环境温度的关系，使他们能够预测本世纪剩余时间海带碳汇潜力的可能变化。这项研究表明，虽然海带分解在低纬度地区会加速，但通过鼓励高纬度地区的海带森林生长，存在增加碳固存的空间。
克里斯·迪克森（神经科学）
我的选择是Bruckner等人的“微生物群通过调节前脑神经元的小胶质细胞重塑来促进社会行为”[9]。这项研究表明，宿主相关的微生物群可以影响斑马鱼的大脑发育并改变社会行为，有助于评估宿主微生物群与神经系统功能之间串扰的新兴科学领域。作者发现，在关键的发育时间窗口内，各种斑马鱼相关细菌菌株的丧失调节了前脑小胶质细胞的丰度和功能，这些动物随后在其正常的社会行为库中表现出缺陷。这些发现是了解宿主相关微生物群与健康和神经发育疾病状态下大脑发育和功能之间复杂关系的第一步。
理查德·霍奇（分子生物学、结构生物学和生物技术）
我的选择是G?belein等人的“活细胞之间的线粒体移植”[10]。在这项研究中，作者提出了一种称为FluidFM的方法，该方法可以有效地直接在活细胞之间移植线粒体。移植可以在没有事先治疗或受体细胞中线粒体DNA消耗的情况下进行。该技术可用于未来的各种实验应用，例如跟踪线粒体变异，分析线粒体动力学，甚至在干细胞疗法中恢复代谢活性低的细胞。
Paula Jauregui（微生物学和免疫学）
我的选择是Burn等人的“古代HERV-K（HML-2）前病毒群在正常人体组织中的广泛表达”[11]。在这项研究中，作者发现以前与疾病相关的人类内源性逆转录病毒也在健康组织中表达。这项研究强调了病毒来源的蛋白质在许多组织中作为人类蛋白质组正常成分的重要性，并表明它们可能有助于尚未发现的生理功能。
Ines Alvarez-Garcia（细胞生物学，信号传导，发育，衰老和植物生物学）
我的选择是Ciesielski等人的“Erebosis，肠道肠细胞稳态周转过程中一种新的细胞死亡机制”[12]。这项研究提出了果蝇肠道肠细胞的新细胞死亡机制，作者称之为“erebosis”。他们提供的证据表明，这是一种独特的细胞死亡形式，在哺乳动物（包括人类）中是保守的，并提出埃雷博病在生理细胞更新期间维持肠道组织稳态。数据的初步性质使其非常适合我们的发现报告格式，未来的研究有望确定调节这一令人兴奋的新过程的erebotic 基因。
剩下的就是感谢在2022年为PLOS Biology做出贡献的作者，审稿人和学术编辑，没有他们，这本期刊就不会存在，感谢你们的阅读，并希望2023年带来更多优秀的科学，可以为我们所有人改变更美好的未来。
引用
1.哈斯·如果淀粉样蛋白驱动阿尔茨海默病，为什么抗淀粉样蛋白疗法还没有减缓认知能力下降？公共科学图书馆生物学. 2022;20（7）：e3001694.密码：35862308
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2.Brown TM， Brainard GC， Cajochen C， Czeisler CA， Hanifin JP， Lockley SW， et al.建议白天、晚上和夜间室内光照，以最好地支持健康成年人的生理、睡眠和觉醒。公共科学图书馆生物学. 2022;20（3）：e3001571.密码：35298459
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3.肯特 BA， 霍尔曼 C， 阿莫亚科 E， 安东尼埃蒂 A， 阿扎姆 JM， 巴尔豪森 H， 等.关于授权早期职业研究人员改善研究文化和实践的建议。公共科学图书馆生物学. 2022;20（7）：e3001680.密码：35797414
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4.Pariente N，代表PLOS Biology Staff编辑。在PLOS Biology首次预注册。公共科学图书馆生物学. 2022;20（3）：e3001611.
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5.肖尔 J， 特里尔 HA， 拉什沃思 MFS， 科林 N.冷漠和强迫对计划和停止顺序决策的影响。公共科学图书馆生物学. 2022;20（3）：e3001566.pmid：35358177
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6.Müller F， De Virgiliis F， Kong G， Zhou L， Serger E， Chadwick J， et al. CBP/p300 激活促进严重残疾慢性实验性脊髓损伤的轴突生长、发芽和突触可塑性。公共科学图书馆生物学. 2022;20（9）：e3001310.密码：36126035
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7.Curreli S，Bonato J，Romanzi S，Panzeri S，Fellin T.海马星形胶质细胞中空间信息的互补编码。公共科学图书馆生物学. 2022;20（3）：e3001530.密码：35239646
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8.Filbee-Dexter K， Feehan CJ， Smale DA， Krumhansl KA， Augustine S， de Bettignies F， et al.由于分解加速，海带碳汇势随变暖而降低。公共科学图书馆生物学. 2022;20（8）：e3001702.密码：35925899
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9.布鲁克纳 JJ， 斯特德尼茨 SJ， 格里斯 MZ， 扎伊丹 D， 马萨夸 MS， 拉尔施 J， 等.微生物群通过调节前脑神经元的小胶质细胞重塑来促进社会行为。公共科学图书馆生物学. 2022;20（11）：e3001838.pmid：36318534
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10.G?belein CG， Feng Q， Sarajlic E， Zambelli T， Guillaume-Gentil O， Kornmann B， et al.活细胞之间的线粒体移植。公共科学图书馆生物学. 2022;20（3）：e3001576.pmid：35320264
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11.伯恩 A， 罗伊 F， 弗里曼 M， 棺材 JM.古代HERV-K（HML-2）前病毒群在正常人体组织中广泛表达。公共科学图书馆生物学. 2022;20（10）：e3001826.密码：36256614
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12.切西尔斯基 HM， 西田 H， 高野 T， 福原 A， 大谷 T， 池川 Y， 等.Erebosis，肠道肠细胞稳态转换过程中的新细胞死亡机制。公共科学图书馆生物学. 2022;20（4）：e3001586.密码：35468130
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