如何编写方法
确保理解、可重复性和可重复性
方法部分应包含哪些内容，以及有多少细节是适当的？
为什么方法很重要
方法部分曾经是论文中最有可能被不公平地缩写、过度总结，甚至降级到出版商网站中难以找到的部分的部分。虽然有些期刊可能负责任地在补充章节中包括更详细的方法要素，但提高科学的可重复性和严格性的运动恢复了方法部分的重要性。方法现在被视为建立所报告研究可信度的一个关键因素，同时公开提供数据和结果。
明确的方法部分影响编辑评价和读者的理解，也是透明度和可重复性的支柱。
例如，可重复性项目：癌症生物学项目于 2013 年启动，旨在复制 50 篇高调癌症论文的实验，但一旦他们了解原始论文中有多少方法细节，将目标修订为 18?篇论文。
方法部分包含的内容
方法部分包含的内容取决于您所从事的领域以及您正在执行哪些实验。然而，PLOS ONE的指导方针很好地概括了大多数期刊的一般原则："材料和方法部分应提供足够的细节，让技术娴熟的调查人员充分复制您的研究。"这里的重点是深思熟虑的：这些方法应该使读者能够理解你的论文，并复制你的研究。然而，没有必要进入一个外行需要的细节水平——重点是那些也受过你所在领域培训的读者，他们拥有适当的技能和知识来尝试复制。
严谨科学的不断原则
使其他研究人员能够理解和复制结果的方法部分是严格、透明和开放科学的一贯原则。目标是彻底的，即使特定的期刊不需要相同的细节水平。可重复性是我们的责任。您不能通过超过最低信息标准来制造任何问题。如果一个期刊仍然有字值限制——无论是整篇文章还是特定章节——并且需要一些方法细节在补充部分，那么只要额外的细节是可搜索和可找到的，这是可以的。
想象一下，复制自己的作品，在未来的岁月
作为 PLOS 关于可重复性和公开出版的演示（UCSF 可重复性系列的一部分）的一部分，我们建议您通过想象您正在为未来的自我写作，复制自己的作品来规划方法部分的细节水平。当你考虑你可能在不同的机构，不同的帐户登录，应用程序，资源和访问水平-你可以帮助自己想象你自己的需要重做确切的实验的特异性水平。考虑：
· 需要提醒哪些详细信息？
· 您使用了哪种细胞系、抗体、软件或试剂，并且它是否具有可以引用的研究资源 ID （RRID）？
· 您在调查中使用了哪个版本的问卷？
· 您到底向参与者展示了哪些视觉刺激，并且是公开提供的吗？
· 您决定排除哪些参与者？
· 在工作中，您调整了哪些流程？
提示：请务必捕获协议的任何更改
如果你复制了作品，你自己也会想知道任何调整，所以你可以猜测其他人也会想这样做。即使您所做的必要调整并不理想，透明度也是确保将来不被视为问题的关键。透明地传达任何非最佳方法或方法约束，远比隐藏这些限制要好得多，因为这种限制可能导致下游的可重复性或道德问题。
阅读整篇论文时，方法的视觉辅助工具会有所帮助
考虑您的方法的视觉表示是否合适，或有助于理解您的过程。视觉参考读者可以很容易地返回，如流程图，决策树，或清单，可以帮助读者更好地了解完整的文章，而不仅仅是方法部分。
道德考虑
除了描述你所做的之外，向读者保证在进行研究时，你也遵循所有相关的道德准则同样重要。虽然道德标准和报告准则通常在论文的单独部分提出，但请确保您的方法和协议实际遵循这些准则。阅读更多有关道德的了解。
现有标准、清单、准则、合作伙伴
虽然方法部分所包含的细节水平应遵循上述严格科学的普遍原则，但各个学科、领域和项目都努力设计和制定一致的标准、准则和工具，以帮助报告所有类型的实验。下面，您将找到一些关键举措。确保您阅读提交给特定期刊的提交指南，以便发现任何后续的期刊或特定领域政策，或要使用的倡议/工具。
提示：通过提供适当的文书工作，保持您的论文向前发展
请务必检查期刊指南，并提供必要的文件与您的手稿提交。收集必要的文档会大大减慢第一轮同行评议的速度，或在提交修订稿时造成延迟。
随机对照试验 –
联合报告试验综合标准 （CONSORT） 项目涵盖旨在防止随机对照试验报告不足的各种举措。主要倡议是一套基于证据的最低建议，用于报告随机试验，称为"联营声明"。
系统审查和元分析 - PRISMA
系统审查和元分析首选报告项目 （PRISMA）是一组基于证据的最低项目，侧重于报告评估随机试验和其他类型的研究的评论。
使用动物的研究 -
到达动物研究： 报告在 Vivo 实验 （到达） 指南鼓励最大限度地利用动物在研究中报告的信息， 从而尽量减少不必要的研究。（原件在PLOS生物学中的研究和建议，以及更新的指南。
实验室协议Protocols.io?已经开发了一个专门用于共享和更新实验室协议的平台，该平台被分配了自己的DOI，并且可以从论文的方法部分进行链接，以提高可重复性。上下文您的协议和改进发现与随附的实验室协议文章在PLOS ONE.
材料、设计和分析的一致报告——MDAR清单
一个由编辑和专家组成的跨出版商小组已经开发、测试并推出了一个清单，以帮助建立和统一生命科学中的报告标准。该清单可供作者用来汇编方法，编辑/审阅者可用于检查方法，在透明报告中规定了一套最低要求，并通过涵盖可能相关的方法项目和考虑，适应生命科学中的任何学科。如果您在生命科学部门并撰写方法部分，请尝试浏览 MDAR 检查表，看看它是否有助于您将所有相关详细信息包含到您的方法中，以及它是否提醒您您可能错过的任何东西。
摘要写作技巧
在编写方法时，您可能发现的主要挑战是保持其可读性，并涵盖可重复性和可重复性所需的所有详细信息。虽然这很难，但不要在严格的信誉标准上妥协！
做
· 请记住未来的可重复性，以及理解性和可读性。
· 遵循清单，以及现场和期刊特定的准则。
· 将对严格和透明科学的承诺视为个人责任，而不仅仅是遵守期刊准则。
· 确定您使用的任何研究资源是否有持久标识符，这些标识符可以在方法部分中特别引用。
· 将您的实验室协议存入 Protocols.io，并建立与它们的永久链接。如果您改进了协议，您可以稍后更新协议，遵守协议的未来科学家也可以更新协议。
· 考虑视觉辅助工具，如流程图、列表，以帮助阅读论文的其他部分。
· 具体说明在实验期间做出的所有决策，有人需要了解您的工作。
不要
· 总结或缩写方法，而不在可发现的补充部分提供全部细节。
· 假设您始终能够记住您是如何进行实验的，或者能够访问私人或机构笔记本和资源。
· 试图隐藏限制或非最佳决策，你必须做出透明是确保研究可信度的关键。